46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5204 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  100 
 
 		 301 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  31.48 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 643 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 596 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  27.73 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  52.83 
 
 		 168 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  47.92 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  28.69 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  48.33 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  40.82 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  22.22 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  36.67 
 
 		 535 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 197 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 228 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  53.49 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  50 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  31.88 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  48.08 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  47.62 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  47.62 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 511 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  41.67 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  25.45 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  32.04 
 
 		 197 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 198 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  41.67 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 197 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>