26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3406 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  50 
 
 		 886 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  43.36 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  53.54 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  30.97 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  32.96 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 470 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 542 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  29.63 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  29.63 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  28.27 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  32.08 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  35.34 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  34.75 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  28.78 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  29.19 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  32.26 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  28.82 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  30.48 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  42.55 
 
 		 194 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  33.93 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  55.56 
 
 		 732 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 974 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  46.3 
 
 		 1301 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>