88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1504 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  96.97 
 
 
231 aa  364  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  50.27 
 
 
241 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  45.37 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1350  methyltransferase type 11  46.51 
 
 
244 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  33.11 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
225 aa  58.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  49.37 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  44.26 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.89 
 
 
258 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
511 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  34.52 
 
 
223 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  54.35 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  30.41 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
238 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08181  hypothetical protein  25.56 
 
 
255 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
293 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  34.52 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
319 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
239 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
310 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
324 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  44.9 
 
 
367 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  35.94 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
359 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
331 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.87 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  33.33 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.32 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 
1106 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  44.9 
 
 
367 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  43.66 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 
273 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  41.94 
 
 
243 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28 
 
 
280 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  39.34 
 
 
265 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47199  predicted protein  36.25 
 
 
323 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
285 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
241 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
328 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
301 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 
199 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
328 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 
320 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
328 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
237 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  38.16 
 
 
270 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
429 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.87 
 
 
287 aa  42  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
217 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  41.54 
 
 
282 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  37.93 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
218 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  35.37 
 
 
327 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
222 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.79 
 
 
233 aa  41.6  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  30 
 
 
296 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  33.78 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
278 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  38.33 
 
 
273 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
204 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  25 
 
 
202 aa  41.2  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>