More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2343 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  100 
 
 
367 aa  737    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  86.63 
 
 
367 aa  589  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  68.8 
 
 
355 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0456  methyltransferase type 11  61.33 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  40.37 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
208 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
240 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34 
 
 
263 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  31.96 
 
 
256 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.07 
 
 
215 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  31.47 
 
 
249 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
204 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
222 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
221 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.02 
 
 
235 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
237 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.56 
 
 
258 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
319 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
251 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
208 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.66 
 
 
228 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.74 
 
 
252 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.35 
 
 
278 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.86 
 
 
205 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
274 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.74 
 
 
417 aa  59.7  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
203 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
711 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.13 
 
 
243 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
199 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
214 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32 
 
 
243 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.17 
 
 
258 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  39.05 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32 
 
 
243 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32 
 
 
243 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 
238 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
239 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.62 
 
 
230 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  35.85 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
634 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
247 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 
293 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
249 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
271 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
237 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
207 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
269 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.37 
 
 
233 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 
216 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
196 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5258  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.37 
 
 
228 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32 
 
 
210 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.84 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
710 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
262 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.71 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 
261 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  32.93 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  34 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  31.82 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
233 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.5 
 
 
240 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
207 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.17 
 
 
247 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
487 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 
229 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.66 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
222 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.75 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2466  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.53 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
207 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>