More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0549 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  80.44 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  64.73 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.54 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  32.2 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  31.69 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  32 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.18 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  32.9 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  43.22 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  34.16 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.11 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.54 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.11 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.11 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.11 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.54 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.17 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.11 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.1 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 267 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.75 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1350  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  35.71 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 624 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 586 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  30.1 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.57 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  26.79 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  23.74 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.79 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 265 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  35.58 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.51 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  35 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.18 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  26 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.91 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>