More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1691 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  544  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  96.56 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  55.36 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  52.77 
 
 		 253 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  52.36 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  52.47 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  52.36 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  53.95 
 
 		 257 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  51.5 
 
 		 251 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  52.68 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  52 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  50.22 
 
 		 305 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  51.34 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  50.22 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  48.7 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  50.22 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  50.22 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  35.15 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  32.29 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  27.16 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  29.65 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.11 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  39.45 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.17 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.4 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.4 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.11 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.45 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.11 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.96 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  46.34 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.18 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.61 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.82 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.84 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  26.15 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.65 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.18 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  28.65 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.62 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  31.94 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.84 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.91 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.69 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.82 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  28.73 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.92 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  33.67 
 
 		 395 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.01 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0015  hypothetical protein  30.14 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0203643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.71 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  31.78 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  31.78 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  31.78 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1033  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00915374  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  31.78 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.18 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.18 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.47 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.65 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  31.78 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.86 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.02 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.02 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  28.18 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.88 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  29.12 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.57 
 
 		 417 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  31.86 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  27.62 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  27.62 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  27.62 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>