More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1844 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  31.68 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  30.3 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.03 
 
 		 347 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.69 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.22 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.78 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  30.7 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.51 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.06 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.53 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.14 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.53 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  27.81 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.46 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.64 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.14 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 331 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.63 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.58 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1504  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.43 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.04 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.29 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.69 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  32.73 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.59 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  24.86 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.65 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.65 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 328 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 328 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.35 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 328 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.62 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.46 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0216  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.709398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  32.31 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 341 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  30.09 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 354 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.95 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>