More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2990 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  60.47 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  60.94 
 
 		 265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  61.6 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  60.38 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  57.42 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  53.28 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  50.35 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.33 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  52.33 
 
 		 282 aa  265  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  53.94 
 
 		 283 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  49.63 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  50.58 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 		 299 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  51.5 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  49.22 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 316 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  52.16 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  50.39 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  54.88 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  41.52 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.03 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.57 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  27.9 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.81 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.81 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.66 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.81 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.81 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.81 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.81 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  31.78 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  34.05 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  27.93 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  32.79 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  31.55 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  32.79 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  31.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  27.62 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  31.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.32 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  27.37 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  31.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  31.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  31.5 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  44.09 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  24.9 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.99 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  26.82 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.11 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  31.4 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  30.81 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  20.69 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  35.04 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.11 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.7 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  43.56 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.51 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  28.77 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.51 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.92 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0650412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>