More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0216 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0216  methyltransferase type 11  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.709398  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1338  methyltransferase type 11  64.8 
 
 
182 aa  231  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  63.13 
 
 
182 aa  225  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1364  methyltransferase type 11  60.11 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.594154 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0524  methyltransferase type 11  42.46 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.89 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.13 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.13 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
309 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.53 
 
 
249 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
310 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.39 
 
 
235 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  36.04 
 
 
347 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  29.49 
 
 
250 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.05 
 
 
236 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.54 
 
 
251 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  31.97 
 
 
261 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.54 
 
 
251 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.54 
 
 
251 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.54 
 
 
251 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
255 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
250 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
226 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.75 
 
 
251 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 
307 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
252 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
250 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
250 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 
249 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
259 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 
249 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
250 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
259 aa  58.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
252 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  34.75 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
229 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
253 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 
305 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
257 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.1 
 
 
228 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
256 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  57.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
257 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
242 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.62 
 
 
215 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.62 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.34 
 
 
231 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
250 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.66 
 
 
256 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
250 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.42 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
254 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.88 
 
 
254 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.6 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  29.6 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
240 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.76 
 
 
249 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
279 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
328 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
250 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.71 
 
 
241 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
411 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
225 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
248 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
307 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
201 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  28.65 
 
 
273 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
201 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 
241 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
634 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
236 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
303 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
236 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
228 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
281 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
269 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
234 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 
230 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>