More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1705 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  37.24 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  30.83 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  36.11 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.62 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  26.47 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  26.47 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  26.44 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  25.98 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.72 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  30.47 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  30.47 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0930  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140476  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  32.41 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  29.13 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  23.42 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  31.72 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  25.2 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 254 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  29.58 
 
 		 291 aa  72  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.57 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  32.14 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  24.41 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.31 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  29.25 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  30.71 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  25.97 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.44 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.26 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  27.66 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  30.97 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  26.77 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.73 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  26.67 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  28.87 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  26.77 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  26.77 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  25.89 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.58 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.79 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  27.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  27.54 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  29.73 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  24.9 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  24.27 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  25.74 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  25.93 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  27.67 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  27.67 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.14 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  31.94 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 267 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  24.78 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  29.76 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  30.77 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.26 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  30.32 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.26 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  30.32 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  36.73 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  28.86 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 634 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  28.92 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  25.52 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.26 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>