More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0035 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  73.06 
 
 
253 aa  389  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
216 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.04 
 
 
312 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  26.63 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  22.87 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  24.51 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  27.13 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  24.23 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.28 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  29.38 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.32 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  32.02 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.72 
 
 
558 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  25.67 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.71 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  29.71 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25.28 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  22.09 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  27.14 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  21.79 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  23.13 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  22.45 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.87 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  28.1 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  28.1 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  23.26 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25.43 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  21.8 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  28.15 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.15 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  22.48 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.15 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  25.19 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  29.46 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  29.46 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  29.46 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  27.41 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  29.46 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  29.46 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.09 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  28.03 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.09 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.09 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.09 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.09 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  28.03 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  24.08 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  26.58 
 
 
295 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.18 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.85 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  22.93 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.52 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  25.41 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.19 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.66 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  25.41 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.84 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  26.35 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.81 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  25.85 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  25.85 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  24.41 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
315 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  26.79 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  25.85 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.05 
 
 
309 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  22.73 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.53 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  26.62 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.31 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  19.92 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  26.79 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  28.37 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  21.46 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  26.62 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  24.6 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  26.26 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.49 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>