More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  95.19 
 
 		 253 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  71.51 
 
 		 254 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  69.35 
 
 		 255 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  71.51 
 
 		 254 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  70.97 
 
 		 254 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  68.28 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  62.37 
 
 		 261 aa  236  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  62.3 
 
 		 256 aa  233  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  58.66 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  57.69 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  59.34 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  55.8 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  59.34 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  56.59 
 
 		 204 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  58.79 
 
 		 256 aa  220  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  56.59 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  58.79 
 
 		 256 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  59.55 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  58.79 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  58.79 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  58.24 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  58.24 
 
 		 207 aa  214  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  58.24 
 
 		 256 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  58.24 
 
 		 256 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  58.24 
 
 		 256 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  58.24 
 
 		 256 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  57.14 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  57.69 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  56.29 
 
 		 173 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  56.98 
 
 		 258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  54.95 
 
 		 250 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 264 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  54.4 
 
 		 250 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.85 
 
 		 251 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  54.95 
 
 		 261 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  54.4 
 
 		 259 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  54.19 
 
 		 256 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 259 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  52.81 
 
 		 254 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  53.3 
 
 		 259 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  52.81 
 
 		 254 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  50.55 
 
 		 250 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  50.55 
 
 		 250 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.75 
 
 		 251 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.75 
 
 		 251 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 258 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  51.89 
 
 		 260 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  50.55 
 
 		 256 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  52.97 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  50.55 
 
 		 250 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.65 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.65 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.65 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.65 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.65 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  51.1 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  51.1 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  50 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  50 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  50 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  50 
 
 		 250 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  49.73 
 
 		 261 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  28.95 
 
 		 261 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.95 
 
 		 258 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  28.95 
 
 		 261 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.95 
 
 		 258 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.95 
 
 		 261 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.36 
 
 		 261 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.42 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.77 
 
 		 261 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 264 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.42 
 
 		 261 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  30 
 
 		 273 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.4 
 
 		 257 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.77 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.16 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  40.96 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  41.03 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 281 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.61 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.89 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.44 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.23 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.27 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2001  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323981  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.44 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.23 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.43 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.23 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.23 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.78 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>