More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1364 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1364  methyltransferase type 11  100 
 
 
181 aa  362  2e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.594154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0216  methyltransferase type 11  60.11 
 
 
184 aa  221  4e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.709398  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1338  methyltransferase type 11  59.44 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  61.11 
 
 
182 aa  218  5e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0524  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
186 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  38 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.27 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  34.9 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
261 aa  62  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  34.78 
 
 
261 aa  61.6  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
249 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  47 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
260 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  42 
 
 
305 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.45 
 
 
251 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
257 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.45 
 
 
251 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.62 
 
 
235 aa  58.9  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
265 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 
237 aa  58.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.81 
 
 
251 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.85 
 
 
206 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
252 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
291 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.61 
 
 
251 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.61 
 
 
251 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.61 
 
 
251 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.61 
 
 
251 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
203 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.61 
 
 
248 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37 
 
 
235 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
307 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  33 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
252 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  41.76 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  36.11 
 
 
263 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.77 
 
 
251 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  32 
 
 
236 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 
238 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32 
 
 
226 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
254 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  32 
 
 
236 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.89 
 
 
250 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
319 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1722  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
259 aa  55.1  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0192579  decreased coverage  0.00000164865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
429 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
250 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
307 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  32 
 
 
236 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
305 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.36 
 
 
345 aa  54.7  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  41 
 
 
246 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.62 
 
 
215 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
255 aa  54.3  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41 
 
 
246 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.22 
 
 
239 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41 
 
 
246 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  32 
 
 
199 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
312 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.35 
 
 
155 aa  54.3  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  31 
 
 
236 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.37 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
411 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.3 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.3 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.7 
 
 
233 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
259 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
256 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.19 
 
 
241 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2332  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.37 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000815001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
254 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.51 
 
 
253 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>