More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2617 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  82.4 
 
 		 233 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  56.31 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  36.41 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  35.9 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 303 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 307 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.8 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.82 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 301 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.04 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.41 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.2 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.76 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.85 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  27.54 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 263 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.9 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  33.83 
 
 		 776 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.36 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  26.95 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  26.95 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.12 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.14 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.35 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  29.25 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.97 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.77 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  26.95 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  39.17 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.81 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  34.07 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  27.21 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  25.75 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.75 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.2 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  30.15 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  34.78 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  26.49 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 		 711 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 341 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  26.35 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  26.35 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  30.86 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  29.94 
 
 		 1014 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.43 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.63 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.37 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.52 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>