More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1001 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  48.44 
 
 
225 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  43.7 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  45.02 
 
 
242 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  40.17 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  42.8 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
242 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
307 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
233 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  36.74 
 
 
228 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  43.3 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.79 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  37.56 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
233 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
315 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.03 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  29.1 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  40 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  40 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  29.27 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  40 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  38.95 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  29.85 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.5 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.5 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  38.95 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.71 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  38.95 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  29.27 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  38.95 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  38.95 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  30.08 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.36 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  29.1 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.5 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27 
 
 
776 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.5 
 
 
277 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.03 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
237 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
275 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  34 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.78 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.23 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  31.29 
 
 
658 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.04 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  33.64 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
319 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 
250 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.04 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.08 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
1005 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>