More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1612 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  100 
 
 
233 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  82.4 
 
 
228 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  57.21 
 
 
228 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  42.33 
 
 
225 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 
244 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
237 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  32.47 
 
 
242 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
248 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  34.14 
 
 
307 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.73 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 
210 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
301 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  30.24 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.74 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
199 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  34.59 
 
 
776 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.51 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.51 
 
 
277 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.51 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.3 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  27.53 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  25.84 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.01 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.85 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  28.78 
 
 
310 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.2 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
710 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
624 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  26.4 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
291 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  26.4 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  26.4 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  26.4 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.39 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.39 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  30.52 
 
 
355 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.39 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
711 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  35.83 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  29.7 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  31.2 
 
 
629 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  25.84 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  25.84 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.91 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.88 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.33 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.65 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  29.46 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
282 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.01 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>