More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1806 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  57.21 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  56.31 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  36.87 
 
 		 307 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  32.16 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.8 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  33.15 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.46 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  32.67 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  26.91 
 
 		 776 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.64 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  34.95 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  31.36 
 
 		 658 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.31 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  23.21 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  33.33 
 
 		 629 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  22.84 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.165122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.78 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 1002 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  35.09 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.83 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.85 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  36.19 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.43 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.63 
 
 		 277 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0349  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.69 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  32.35 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.45 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  35 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  20.61 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  24.62 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  21.88 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  21.6 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.59 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 1039 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  28.16 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  27.78 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 1005 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.98 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>