More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0639 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  100 
 
 
307 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  41.47 
 
 
237 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  34.73 
 
 
244 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  34.14 
 
 
233 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
228 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  35.2 
 
 
228 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.96 
 
 
243 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  47.18 
 
 
235 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 
242 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
233 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
248 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.27 
 
 
261 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  30.23 
 
 
776 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
248 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.07 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  40.21 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  28.65 
 
 
204 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
200 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
200 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  42 
 
 
215 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.08 
 
 
202 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.82 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
245 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  34.34 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
210 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  47.17 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
201 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.61 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  21.76 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.96 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.4 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  31.61 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
218 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
204 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.1 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
1106 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
204 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
247 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
265 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  41.74 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  34.01 
 
 
209 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  41.41 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  42.71 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 
208 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  40.87 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  40 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.44 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.41 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.02 
 
 
205 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  32 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.73 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  39.25 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  37.14 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  39.45 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
237 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  36.89 
 
 
213 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.78 
 
 
206 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  32.17 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
202 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0691  Methyltransferase type 11  44.76 
 
 
205 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
244 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.1 
 
 
258 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  31.09 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
232 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>