More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2546 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  66.26 
 
 
247 aa  292  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  56.61 
 
 
259 aa  254  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  38.62 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  41.33 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.26 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.51 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  38.54 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  45.36 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.19 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
291 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  42.74 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1106 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.32 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.14 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  38 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.57 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 
711 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.97 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  45.92 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  39.82 
 
 
710 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
354 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.34 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
675 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  29.22 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  39.78 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  36.11 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.62 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.27 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.2 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.07 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  38 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.48 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  30.25 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.52 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.1 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.76 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  37.14 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  40 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  32.67 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.41 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.18 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.39 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  40.43 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.6 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  40 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  42.55 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  34.65 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  41.51 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  36 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>