More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0952 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  44.27 
 
 
281 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  45.68 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  45.6 
 
 
276 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2700  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
274 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1485  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000041456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  42.63 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0522  methyltransferase type 11  46.28 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146489  normal  0.549462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
251 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  41.33 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.97 
 
 
205 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  46.9 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
200 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
200 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  46.36 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  40.83 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  44.66 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.22 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.08 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  34.73 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.78 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.54 
 
 
218 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  38.12 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  48.08 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25 
 
 
211 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.73 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  41.9 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.46 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4907  predicted protein  28 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27365  normal  0.859905 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  39.81 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.88 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  43.86 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  39.19 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.44 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  41.9 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  37.24 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.38 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.34 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.44 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.06 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.44 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.67 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  44.66 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  45.54 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
417 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.06 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.36 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.35 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  38.14 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.05 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.22 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  49.07 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.02 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.5 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>