More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1755 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  80.97 
 
 
276 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  53.11 
 
 
281 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2700  methyltransferase type 11  44.36 
 
 
274 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  45.68 
 
 
272 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1485  Methyltransferase type 11  39 
 
 
219 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000041456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 
225 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  30 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0522  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146489  normal  0.549462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4907  predicted protein  26.37 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27365  normal  0.859905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
189 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
236 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.41 
 
 
233 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  26.55 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.24 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.83 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
199 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.21 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46770  predicted protein  25.48 
 
 
412 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1730  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
232 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.294511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.67 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.32 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.39 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  32.03 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.19 
 
 
236 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0152496  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  27.3 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.8 
 
 
202 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2496  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.19 
 
 
236 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.69 
 
 
234 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  26 
 
 
205 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
284 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  26.19 
 
 
271 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.66 
 
 
235 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  32.41 
 
 
351 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  28.97 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  28.97 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  28.97 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.33 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  28 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.68 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  29.46 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.87 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  24.48 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.73 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.56 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.97 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.31 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>