More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4584 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  100 
 
 
675 aa  1336    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
250 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
258 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
637 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
251 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
252 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  29.78 
 
 
663 aa  101  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
257 aa  100  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
304 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 
262 aa  95.9  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
249 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
264 aa  94.4  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
257 aa  94  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  43.97 
 
 
259 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
246 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
262 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
257 aa  90.9  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
255 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
246 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  30.2 
 
 
253 aa  88.2  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  28.52 
 
 
262 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  36.24 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
244 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  32.43 
 
 
245 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  29.48 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
638 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 
255 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  32.19 
 
 
259 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  27.8 
 
 
254 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
247 aa  72.8  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
276 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 
243 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  29.53 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2027  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  37.1 
 
 
242 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.46 
 
 
266 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
221 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  38.68 
 
 
152 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.23 
 
 
225 aa  65.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
251 aa  63.9  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  32.41 
 
 
276 aa  63.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.63 
 
 
541 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  25.37 
 
 
281 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.61 
 
 
225 aa  62  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 
208 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
259 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  32.23 
 
 
268 aa  61.6  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.79 
 
 
230 aa  61.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  31.03 
 
 
253 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.63 
 
 
541 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 
258 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  31.01 
 
 
272 aa  61.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
225 aa  61.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
250 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
250 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
250 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  35.24 
 
 
212 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
354 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.37 
 
 
190 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.38 
 
 
259 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
262 aa  59.7  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 
541 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.45 
 
 
258 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 
272 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
247 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
250 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
268 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
238 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  28.7 
 
 
541 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.21 
 
 
258 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
240 aa  58.9  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
282 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  37.84 
 
 
194 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
257 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 
541 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  34.27 
 
 
250 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
197 aa  58.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
250 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  32.08 
 
 
243 aa  58.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
267 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
259 aa  58.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
250 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 
230 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 
230 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
282 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>