More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2049 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  100 
 
 
242 aa  486  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 
237 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  47.46 
 
 
237 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  53.65 
 
 
246 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  46.7 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  38.08 
 
 
241 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  53.97 
 
 
152 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  45.83 
 
 
254 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  43 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  40 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
675 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.82 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  29.29 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  29.9 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  32.65 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.91 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.4 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
286 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.03 
 
 
231 aa  62  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.01 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  29.79 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.56 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.09 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  31.31 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  25.28 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  27.66 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.8 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.04 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.58 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  32.29 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  21.28 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
285 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  21.37 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
285 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.24 
 
 
259 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
285 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
285 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.45 
 
 
252 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.82 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  29.52 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  32.58 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  29.52 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  33.87 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.63 
 
 
541 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  43.69 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.04 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  37.25 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.58 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.4 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  31.13 
 
 
541 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.63 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  31.13 
 
 
541 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.58 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.03 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.87 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.44 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.44 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.44 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.48 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.44 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.44 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  23.94 
 
 
280 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.82 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.19 
 
 
541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  33.94 
 
 
202 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
575 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>