280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4135 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  49.78 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  51.48 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  46.7 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  42.62 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  42.76 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  39.46 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  31.15 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  33.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  33.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  33.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  33.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  33.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  32.77 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  32.33 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  36.11 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  28.43 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  33.83 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  32.33 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  32.33 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  30.23 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  30.71 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  28.91 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.13 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  28.18 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  30.08 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.16 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  33.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  32.35 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  27.43 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  27.43 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  24 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.19 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.4 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.58 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30.77 
 
 		 559 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.71 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 675 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  35.2 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  30.94 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  22.55 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>