More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1762 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  100 
 
 
201 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  49.74 
 
 
390 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  44.33 
 
 
201 aa  201  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  47.15 
 
 
201 aa  180  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  39.69 
 
 
202 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  38.19 
 
 
203 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  35.2 
 
 
200 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  35.75 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.41 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  29.31 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  35.59 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  34.64 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  34.01 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  33.9 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  33.9 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  33.9 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  35.1 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  32.3 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  32.77 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.71 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  37.29 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.45 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
257 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
209 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
249 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  32 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  30.07 
 
 
275 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.7 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  37.38 
 
 
239 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  27.86 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
222 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.78 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.09 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  26.37 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
253 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  31.37 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.37 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  33.08 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  33.08 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  33.08 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28.21 
 
 
218 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.9 
 
 
263 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  33.08 
 
 
249 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  33.08 
 
 
249 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
266 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
281 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  30.07 
 
 
249 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  24.84 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
233 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
250 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.43 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  32 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  32.31 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.99 
 
 
296 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.67 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  28.29 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  30.39 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  26.94 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  25.6 
 
 
263 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>