More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1298 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  78.89 
 
 
294 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  55 
 
 
254 aa  270  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  41.44 
 
 
248 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  39.1 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  36.98 
 
 
246 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.76 
 
 
266 aa  116  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 
247 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
273 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
249 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
276 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  30.93 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  32.31 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  32.31 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  31.88 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  31.88 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.28 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  32.31 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.49 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.45 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  30.04 
 
 
249 aa  92  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
249 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  29.61 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  28.39 
 
 
244 aa  89  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.04 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  24.58 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  22.12 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  29.72 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  26.72 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  27.59 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.27 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  24.68 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.42 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.89 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.89 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  29.44 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
247 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  38.46 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  35.15 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.5 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  27.57 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.17 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  22.84 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  26.98 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  24.24 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  21.08 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.06 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  25.21 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  23.11 
 
 
220 aa  62.4  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  33.06 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  26.48 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  28.89 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  26.13 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  31.54 
 
 
541 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  31.54 
 
 
541 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 
190 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.26 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  26.46 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.77 
 
 
541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  31.54 
 
 
541 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  26.16 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
637 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  30.37 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.26 
 
 
541 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  24.91 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  55.32 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 
315 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  23.58 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  25.33 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  29.85 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>