More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0712 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  37.86 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  36.97 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  39.11 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 261 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  40.08 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  33.2 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  31.87 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.13 
 
 		 675 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  25.7 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  24.6 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 637 aa  88.6  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 304 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  35.97 
 
 		 663 aa  83.2  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  25.88 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.94 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.64 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  23.66 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  30.14 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.46 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.96 
 
 		 541 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.47 
 
 		 541 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.27 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  30.81 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.94 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  25.98 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.27 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.1 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.23 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.13 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.43 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  33.86 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.96 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.69 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  24.41 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  24.41 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.82 
 
 		 407 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  24.41 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 360 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  24.41 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.51 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  24.41 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>