135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3114 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  100 
 
 
247 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  43.31 
 
 
255 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
249 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
252 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
271 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.39 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
637 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  26.41 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  24.27 
 
 
663 aa  69.7  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  22.71 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  22.78 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  25.2 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  22.87 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.15 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  42.19 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  22.66 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
675 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  24.1 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  19.6 
 
 
258 aa  52  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1575  hypothetical protein  26.75 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00527276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.68 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.29 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  23.56 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  23.2 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  29.31 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  31.82 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  22.27 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  22.82 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  29.67 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  25.85 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  24.79 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  29.9 
 
 
200 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  21.43 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  35.29 
 
 
199 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  35.44 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  40.91 
 
 
419 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  28 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.59 
 
 
194 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  25.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  25.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  25.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  27.1 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  30.19 
 
 
198 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
190 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  25.58 
 
 
190 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  21.78 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  23.92 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  35.79 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.04 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
295 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  25 
 
 
253 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  24.41 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2027  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  22.73 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  20.95 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  22.69 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  22.63 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  22 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  23.78 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>