More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12286 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  100 
 
 
353 aa  715    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  72.91 
 
 
355 aa  524  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  72.91 
 
 
355 aa  524  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  72.91 
 
 
355 aa  524  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  69.54 
 
 
360 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  70.57 
 
 
376 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  52.17 
 
 
365 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  54.49 
 
 
365 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  51.17 
 
 
344 aa  368  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  57.06 
 
 
369 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  48.98 
 
 
356 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  48.98 
 
 
356 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  54.36 
 
 
380 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  54.87 
 
 
360 aa  352  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  54.49 
 
 
356 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  50.86 
 
 
363 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  47.38 
 
 
360 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  43.68 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  45.06 
 
 
360 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  46.72 
 
 
367 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  41.57 
 
 
366 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  32.95 
 
 
351 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 
351 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 
351 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  31.1 
 
 
357 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  30.79 
 
 
357 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  33.55 
 
 
357 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 
353 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  31.27 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.23 
 
 
349 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  34.71 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  32.27 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.92 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  31.07 
 
 
351 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
353 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.59 
 
 
341 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  29.65 
 
 
353 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
351 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  30.63 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  33.14 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 
360 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  28.83 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  31.31 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.93 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  28.7 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  30.51 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
358 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
348 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  28.7 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  31.02 
 
 
362 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.64 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  27.18 
 
 
416 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
237 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
246 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.5 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
265 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  29.01 
 
 
242 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
244 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  26.29 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  29.27 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.32 
 
 
1676 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  29.55 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
225 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
279 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.83 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
208 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  25.66 
 
 
269 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  24.38 
 
 
239 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  23.75 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  23.75 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  23.75 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  25.27 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.73 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  24.38 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
267 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.19 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.32 
 
 
269 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
275 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.26 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.71 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.7 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 
262 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  31.3 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
281 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
255 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
278 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
263 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>