236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2574 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  100 
 
 
363 aa  744    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  67.82 
 
 
360 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  53.39 
 
 
365 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  52.1 
 
 
360 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  53.63 
 
 
363 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  47.29 
 
 
356 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  47.86 
 
 
356 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  51.4 
 
 
365 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  44.74 
 
 
344 aa  335  7e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  49.03 
 
 
367 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  44.79 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  44.79 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  44.79 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  47.55 
 
 
380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  44.63 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  43.68 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  47.08 
 
 
360 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  44.29 
 
 
356 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  45.88 
 
 
369 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
366 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  33.05 
 
 
357 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  32.49 
 
 
357 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  35.37 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  32.86 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 
353 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  30.81 
 
 
353 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  31.5 
 
 
351 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  29.89 
 
 
351 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 
351 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  31.97 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  34.3 
 
 
357 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  32.29 
 
 
360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 
360 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  28.94 
 
 
353 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  31.44 
 
 
357 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  31.52 
 
 
349 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  31.23 
 
 
350 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  29.94 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.68 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  30.97 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  31.41 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  30.84 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  33.44 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.37 
 
 
351 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
362 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  30.84 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.36 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  28.16 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  30.84 
 
 
348 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
356 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  26.85 
 
 
416 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  23.67 
 
 
653 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
274 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.55 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
265 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  30.07 
 
 
230 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  26.77 
 
 
335 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4218  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  39.68 
 
 
216 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
335 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.88 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  25.2 
 
 
242 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  26.67 
 
 
205 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
261 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  35 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  33.67 
 
 
535 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
256 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.83 
 
 
263 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
263 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  29.31 
 
 
313 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  32.32 
 
 
535 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.95 
 
 
213 aa  49.7  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
205 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.94 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  22.02 
 
 
580 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  34.74 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.07 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
209 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25 
 
 
779 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  28.74 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.04 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>