More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6246 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 349 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  57.88 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  52.29 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  50.86 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  51.73 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  51.44 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  50.86 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  54.62 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  52.89 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  50.57 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  52.89 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  52.31 
 
 		 348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  52.01 
 
 		 351 aa  359  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  51.14 
 
 		 353 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  50.29 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  50.29 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  51.3 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  49.28 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  46.55 
 
 		 351 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  50.57 
 
 		 351 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  47.26 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  50 
 
 		 359 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  50 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  47.41 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  46.67 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  45.24 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  42.52 
 
 		 343 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  34.47 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  33.9 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  33.42 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  34.04 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  34.04 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  34.99 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  38.06 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  35.95 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  33.73 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  32.65 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  31.44 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  33.44 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 416 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  77.5 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  29.46 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.73 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  29.73 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  30.16 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 264 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 276 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.94 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  31.9 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.07 
 
 		 447 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.6 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  34.62 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.86 
 
 		 580 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.07 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.6 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>