223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3870 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  100 
 
 
357 aa  732    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  66.48 
 
 
358 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  65.81 
 
 
357 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  60.59 
 
 
343 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  54.52 
 
 
351 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  54.93 
 
 
351 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  54.52 
 
 
351 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  55.4 
 
 
351 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  53.93 
 
 
360 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  51.72 
 
 
353 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  52.42 
 
 
360 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  52.56 
 
 
353 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  51.42 
 
 
351 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  52.57 
 
 
350 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  48.85 
 
 
353 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  49 
 
 
348 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  49.57 
 
 
348 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  49 
 
 
348 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  47.85 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  44.41 
 
 
348 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  47.71 
 
 
348 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  47.47 
 
 
351 aa  311  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  44.48 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  44.96 
 
 
349 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  42.7 
 
 
357 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  44.25 
 
 
359 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  38.07 
 
 
357 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.78 
 
 
357 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
356 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
355 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  35.26 
 
 
363 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 
341 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
365 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  32.76 
 
 
380 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  29.53 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  32.27 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  28.25 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  28.25 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  30.51 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.97 
 
 
355 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.97 
 
 
355 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.97 
 
 
355 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
363 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.75 
 
 
418 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  28.61 
 
 
365 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  31.42 
 
 
369 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  27.65 
 
 
376 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
356 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
360 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  26.91 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
367 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.44 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
226 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.36 
 
 
395 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
187 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
285 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
187 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.68 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.54 
 
 
287 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  31 
 
 
439 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  36 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  27.61 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.11 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  31.91 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
267 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  27.92 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
283 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 
236 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  32 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.3 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
274 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  27.7 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  25.44 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.1 
 
 
259 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.21 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0904  O-methyltransferase family 3  36.9 
 
 
222 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.84 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
270 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  29.19 
 
 
832 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  32.14 
 
 
226 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
270 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>