More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3178 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  62.2 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  46.12 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  45.8 
 
 		 280 aa  185  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  47.6 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1251  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 216 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000494899  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3596  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  32.12 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  34.59 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  35.4 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3456  hypothetical protein  31.87 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.32 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  36.59 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 187 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0687  hypothetical protein  28.83 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  30.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.24 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.23 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.95 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.14 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4274  hypothetical protein  27.09 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0246  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  28.46 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 355 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.4 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  33 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.6 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 349 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 853 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2627  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.55 
 
 		 433 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  41.12 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  31.09 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.27 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2748  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>