More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1083 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  534  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 369 aa  89  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 1106 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 1032 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0931  hypothetical protein  30.41 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 810 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.61 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.17 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.48 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.89 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  27.88 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.12 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.02 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.41 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  25 
 
 		 885 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 634 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.97 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  28.11 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  24 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  27.61 
 
 		 418 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.24 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.7 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  26.61 
 
 		 356 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.85 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.28 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.61 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 306 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.33 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  31.69 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.75 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.75 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.98 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  28.32 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  27.42 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.29 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 439 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  25.68 
 
 		 870 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.42 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  23.3 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.2 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 363 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  25 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  24.83 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.69 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0740  type 11 methyltransferase  25.79 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0965095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.93 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  23.36 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  23.36 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  23.24 
 
 		 359 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.89 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.3 
 
 		 447 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 440 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.83 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.09 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 		 1340 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 349 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  25.62 
 
 		 395 aa  48.9  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>