More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0752 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.72 
 
 		 345 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  40.37 
 
 		 353 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 353 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 303 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  33.71 
 
 		 273 aa  98.2  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 317 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  39.84 
 
 		 323 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 358 aa  95.9  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 306 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 310 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 286 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 306 aa  89  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 282 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 335 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 275 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 300 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30.66 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.18 
 
 		 672 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 332 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  36.17 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  32.7 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 383 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  35.77 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  31.38 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  38.56 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  29.17 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  33.58 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 1037 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  32.39 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.67 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.22 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 996 aa  72.4  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  20 
 
 		 415 aa  71.6  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  33.78 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  37.04 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.38 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 1162 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.46 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  28.65 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 318 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  31.39 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.99 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 		 1523 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  32.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  32.89 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.37 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 1094 aa  65.1  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 1177 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 1177 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  36.64 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  30.07 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.37 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.28 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.5 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  31.69 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.91 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.46 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  28.48 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 581 aa  62.8  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  28.95 
 
 		 447 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  28.67 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  28.95 
 
 		 447 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.12 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  27.54 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.85 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>