220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1706 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  100 
 
 		 353 aa  721    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  57.88 
 
 		 349 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  52.89 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  53.76 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  54.13 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  51.28 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  51.99 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  51.99 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  51.7 
 
 		 351 aa  361  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  51 
 
 		 351 aa  361  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  50.28 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  51 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  50.57 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  52.72 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  48.71 
 
 		 350 aa  342  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  48.14 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  51.43 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  49.29 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  51 
 
 		 348 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  50.14 
 
 		 348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  50.14 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  47.14 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  48.29 
 
 		 348 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  48.15 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  44.48 
 
 		 357 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  48 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  43.7 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  34.47 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  34.19 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  31.72 
 
 		 376 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  29.34 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  29.34 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  33.23 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  31.77 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  27.79 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  28.53 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.23 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  33.64 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.94 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  24 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.82 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  25.77 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  32.74 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  22.29 
 
 		 205 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.34 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  25.99 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  27.55 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  27.55 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  36.25 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  34.62 
 
 		 780 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 271 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 287 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 		 230 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  22.94 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.69 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  38.55 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>