More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5520 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  100 
 
 
306 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  47.65 
 
 
300 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  44.1 
 
 
298 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  42.81 
 
 
282 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  42.03 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  41.1 
 
 
287 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  42.75 
 
 
273 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  31.07 
 
 
313 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 
311 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  32.06 
 
 
312 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  30.49 
 
 
310 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  34.68 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  27.39 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
330 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.65 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  31.85 
 
 
330 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.61 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  35.15 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.38 
 
 
672 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27 
 
 
345 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.58 
 
 
305 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 
305 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
317 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.02 
 
 
353 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.02 
 
 
353 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
318 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.73 
 
 
277 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  27 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
214 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.44 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
267 aa  93.2  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  25 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25.55 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  29.52 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28.36 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  29.2 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  26.61 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  29.96 
 
 
625 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.98 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.8 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  27.56 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  27.56 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.4 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  26.22 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.58 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.69 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25.9 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
1177 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 
607 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
1177 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  26.12 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  25.51 
 
 
613 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
996 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  28.65 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  23.19 
 
 
572 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  26.19 
 
 
371 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  21.95 
 
 
513 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  28.48 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0452  hypothetical protein  26.21 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  27.85 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  27.22 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  27.22 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  27.22 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  27.22 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.2 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  27.85 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
1046 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  28.75 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  34.35 
 
 
237 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  25.35 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  27.22 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  36.89 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
194 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  25.47 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  26.9 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
229 aa  58.9  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
274 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>