More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3261 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  68.83 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  66.93 
 
 		 259 aa  334  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  67.61 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  66.14 
 
 		 259 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  66.14 
 
 		 259 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  67.61 
 
 		 274 aa  315  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  62.85 
 
 		 261 aa  314  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  60.32 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  55.19 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  45.75 
 
 		 1106 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 1032 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  36.65 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 885 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.75 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  30.26 
 
 		 870 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  38 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.07 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.26 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  29.38 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.75 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 810 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.34 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.82 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  28.4 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.32 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  33.01 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  26.06 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.36 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  27.04 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.85 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  42 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.97 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  35.64 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.21 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.84 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.87 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26.99 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>