More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5779 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  100 
 
 
270 aa  537  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 
269 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  51.7 
 
 
273 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  50.96 
 
 
266 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  44.06 
 
 
265 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  39.15 
 
 
272 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  39.11 
 
 
268 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  40.39 
 
 
274 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
267 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  35.69 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
267 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  32.55 
 
 
264 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
253 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
253 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
252 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  44.55 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.81 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.44 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
363 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.33 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.66 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.04 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.81 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.07 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.1 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  31.89 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  38.13 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.07 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.55 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  28.91 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.51 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  40.22 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.58 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  30.51 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  29.63 
 
 
223 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
198 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
198 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  36.84 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>