More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3054 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  80.49 
 
 		 287 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  79.44 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  81.53 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  78.75 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  43.16 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  42.5 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  44.88 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.99 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  46.34 
 
 		 240 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.49 
 
 		 291 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  36.24 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.43 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  41.45 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  41.07 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  41.07 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  41.07 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  41.07 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  41.07 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  45.68 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  40.71 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  43.42 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  39.72 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  39.1 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  39.15 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  38.35 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  44.33 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  37.18 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.05 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  37.2 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  34.7 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.01 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.1 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.95 
 
 		 526 aa  86.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  34.32 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.7 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.19 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  32.26 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  41.9 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  41.9 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  42.45 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.06 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.5 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.52 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  40.95 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>