More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1979 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  100 
 
 
240 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  47.74 
 
 
287 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  42.19 
 
 
285 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  44.07 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  46.5 
 
 
287 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  47.74 
 
 
287 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.84 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  46.34 
 
 
290 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 
287 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  45.76 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  42.55 
 
 
280 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  42.8 
 
 
281 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  41.7 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.82 
 
 
291 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  43.53 
 
 
281 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  40 
 
 
282 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  40 
 
 
282 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  43.15 
 
 
285 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
290 aa  144  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  39.15 
 
 
282 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.46 
 
 
282 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  41.63 
 
 
285 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  34.9 
 
 
325 aa  138  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  40.51 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  37.34 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  37.34 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  37.34 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  37.34 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  37.34 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  37.34 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  45.76 
 
 
275 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  36.82 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  43.22 
 
 
279 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  36.82 
 
 
305 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
281 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  36.21 
 
 
275 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  45.64 
 
 
270 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 
255 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
291 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 
259 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.25 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  32.3 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
526 aa  89.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  37.58 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
415 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.26 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.5 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.84 
 
 
287 aa  82  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  39.05 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.05 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
299 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  39.5 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  30 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  22.59 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.19 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.59 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.75 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
272 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
272 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  42.31 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  42.57 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  36.27 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.38 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.95 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  39.42 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1762  demethylmenaquinone methyltransferase  32.73 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  27.14 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.83 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>