More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0964 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  100 
 
 
281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  80.71 
 
 
282 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  80.36 
 
 
282 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  52.94 
 
 
275 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  51.61 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  51.1 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  43.93 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.94 
 
 
285 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.34 
 
 
285 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  35.59 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  40.14 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
280 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  40.86 
 
 
281 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  41.64 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  44.73 
 
 
240 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 
283 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.05 
 
 
282 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.72 
 
 
287 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  37.05 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  37.05 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  37.68 
 
 
291 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
282 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  40.29 
 
 
282 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  37.91 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  37.91 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  37.91 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  37.91 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  37.91 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 
287 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  38.99 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.46 
 
 
290 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  36.88 
 
 
305 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
287 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  39.58 
 
 
287 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.25 
 
 
291 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
290 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
285 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  37.73 
 
 
270 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  36.56 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  40.8 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
275 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
286 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  35.4 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
281 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
255 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
281 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  29.72 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
526 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.53 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.73 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.48 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.22 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  28 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.14 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  43.22 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.89 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  34.51 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.29 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  41.01 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  30 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  28.4 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.26 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.27 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3492  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.87 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.26 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  30.14 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.27 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.41 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.19 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.79 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
1000 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.7 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.79 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.05 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.8 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  33.33 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  36.43 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>