More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4560 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  69.37 
 
 
279 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  71.32 
 
 
272 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  60.61 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  59.93 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  58.87 
 
 
269 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  59.26 
 
 
272 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  53.41 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  52.09 
 
 
269 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  43.8 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  43.69 
 
 
526 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1935  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.7 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  42.22 
 
 
825 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.23 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  46 
 
 
212 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  33.79 
 
 
865 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  32.19 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
581 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.65 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  36.72 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.84 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.69 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  46.23 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.97 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  41.07 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.82 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.86 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.24 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  43.27 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.41 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.14 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
415 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.15 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39585  predicted protein  35.61 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  31.55 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3512  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.25 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000892399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.46 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.7 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.52 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  41.12 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  42.34 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.52 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.52 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  44.54 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.27 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.52 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.62 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.07 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  32.12 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.89 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.94 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.99 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>