More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4427 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  71.43 
 
 		 269 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  70.19 
 
 		 266 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  51.7 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  39.54 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  36.03 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  35.04 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 248 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  39.38 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  36.86 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  41.47 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  36.44 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.25 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.33 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  31.97 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  41.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  38.14 
 
 		 832 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.5 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  33.05 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.47 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.21 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.54 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.57 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.38 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  37.5 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  31.71 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.46 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.18 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>