More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5806 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  100 
 
 
275 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  74.91 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  52.94 
 
 
282 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  52.21 
 
 
282 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  53.31 
 
 
281 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  46.52 
 
 
288 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  42.07 
 
 
285 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  42.18 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.39 
 
 
285 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
285 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  51.23 
 
 
285 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.6 
 
 
290 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  44.24 
 
 
287 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.15 
 
 
291 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  44.6 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  42.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  42.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  42.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  42.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  42.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  42.55 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 
287 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  43.53 
 
 
287 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  46.19 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  41.09 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.32 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  39.43 
 
 
284 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  39.19 
 
 
282 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  43.07 
 
 
281 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  39.56 
 
 
282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  39.56 
 
 
282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  42.34 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  40.22 
 
 
282 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  39.78 
 
 
281 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  40.22 
 
 
282 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
283 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
290 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
285 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
281 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  40.15 
 
 
275 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  42.46 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.36 
 
 
283 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  36.79 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  40.36 
 
 
260 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  40.44 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  34.47 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.25 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  42.62 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.79 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  34.27 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.28 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.6 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.81 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  33.33 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  40 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  31.4 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.74 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
225 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.77 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
257 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  35.04 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.03 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.67 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.67 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.08 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.7 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  38.33 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  34.16 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
1000 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>