More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1612 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 255 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  59.07 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  46.27 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  44.7 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  40.36 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  42.53 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 287 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.7 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.16 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  42.75 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  39.89 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.79 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  39.88 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  35.18 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  34.2 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  34.81 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  36.53 
 
 		 283 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.1 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  33.48 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.75 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  36.99 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.89 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  36.99 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  36.42 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.59 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.92 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 526 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  40.2 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  30.11 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  36.97 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.36 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  37.86 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.93 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 581 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.05 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>