More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4115 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  55.21 
 
 
274 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  50.57 
 
 
268 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  47.13 
 
 
267 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  45.95 
 
 
263 aa  235  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  50.38 
 
 
267 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  48.85 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  46.61 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  39.15 
 
 
270 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
266 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
262 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
269 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
253 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
252 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  32.55 
 
 
265 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 
253 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
248 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
248 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
248 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
249 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
253 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.75 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  34.38 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  37.31 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.46 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.65 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  37.4 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.95 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
246 aa  55.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  36.04 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  39.8 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  33.56 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  25.43 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  37.74 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.56 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
202 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.96 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  36.84 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  24.64 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.45 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.11 
 
 
201 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.46 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.97 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.23 
 
 
256 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
253 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.09 
 
 
272 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
269 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  30.23 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  34.96 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.91 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>