More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1364 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 		 580 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  58.21 
 
 		 661 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  52.81 
 
 		 865 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  45.86 
 
 		 653 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  40.15 
 
 		 780 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 779 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  41.46 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  37.83 
 
 		 1676 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  37.18 
 
 		 704 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  33.92 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.78 
 
 		 875 aa  250  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  26.64 
 
 		 414 aa  97.8  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 402 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  27.83 
 
 		 407 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 390 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.51 
 
 		 407 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.3 
 
 		 399 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.68 
 
 		 402 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  27.96 
 
 		 403 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 434 aa  90.9  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.3 
 
 		 395 aa  90.1  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 441 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 441 aa  88.2  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 360 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  24.9 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.98 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  23.98 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  25.1 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  26.2 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  25.5 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.12 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  24.9 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  35.05 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 268 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.85 
 
 		 269 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  62.5 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 267 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  50.85 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.85 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  52.83 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  36.63 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  63.83 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  58.49 
 
 		 685 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  22.02 
 
 		 238 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  58.33 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  24.88 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  30.61 
 
 		 239 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.4 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.4 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 		 269 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 258 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 254 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  50.85 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 232 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  30.36 
 
 		 269 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 232 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.95 
 
 		 232 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2940  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.41 
 
 		 270 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  27.46 
 
 		 289 aa  55.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  56 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 710 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  29.37 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 218 aa  54.7  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29.76 
 
 		 269 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  22.61 
 
 		 287 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 232 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 296 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 339 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 271 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 296 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 226 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 239 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>