More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6570 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  100 
 
 		 416 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  49.75 
 
 		 363 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  51.66 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  44.58 
 
 		 356 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  43.47 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  30.63 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  33.23 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  32.9 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.75 
 
 		 353 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  32.01 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  30.88 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  29.66 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  30.4 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  30.4 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  30.48 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31.84 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  29.32 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  29.32 
 
 		 357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  31.05 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  27.88 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  31.81 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  26.77 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  26.52 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  24.03 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  28.42 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  26.43 
 
 		 376 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  27.22 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  28.53 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  31.06 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.3 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.26 
 
 		 235 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.4 
 
 		 276 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.55 
 
 		 239 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.49 
 
 		 237 aa  53.5  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.49 
 
 		 237 aa  53.5  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 311 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 285 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.74 
 
 		 238 aa  53.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.04 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.2 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 278 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.28 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.19 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  36.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.37 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1889  O-methyltransferase  26.15 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 191 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.05 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.26 
 
 		 238 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 230 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 287 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  25.58 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.64 
 
 		 249 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 263 aa  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>