More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0550 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  100 
 
 
356 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  51.64 
 
 
363 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  48.16 
 
 
355 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  48.47 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  44.64 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  35.33 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 
358 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 
357 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  33.65 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
351 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  32.24 
 
 
353 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35.01 
 
 
348 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  34.08 
 
 
360 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  34.18 
 
 
360 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.85 
 
 
351 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  34.06 
 
 
348 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  30.68 
 
 
353 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  31.85 
 
 
357 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  32.48 
 
 
357 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
348 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  34.38 
 
 
348 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  31.34 
 
 
348 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
349 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  29.55 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  34.12 
 
 
359 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  33.92 
 
 
350 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  34.33 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  33.44 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
351 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
353 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
353 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
351 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  27.64 
 
 
351 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31.56 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
356 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.15 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31.05 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  30.15 
 
 
341 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  30.36 
 
 
353 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
363 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  28.73 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.57 
 
 
344 aa  119  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  30.12 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  25.5 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  25.85 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  29.2 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  26.82 
 
 
360 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  26.75 
 
 
360 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.13 
 
 
376 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
360 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
274 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  37.32 
 
 
236 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.43 
 
 
240 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  27.03 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.32 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.69 
 
 
280 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.5 
 
 
280 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.86 
 
 
253 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.03 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.32 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.23 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  35.78 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
238 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  30 
 
 
422 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
268 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.95 
 
 
252 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.53 
 
 
245 aa  53.1  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
266 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
254 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.96 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.43 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.08 
 
 
238 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 
236 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 
230 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 
223 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  25.3 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.95 
 
 
263 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>